Obsah
Peptidy jsou fragmenty krátkých polymerů složených z aminokyselin. Každý peptid má určitou sekvenci aminokyselin označenou třípísmenným kódem nebo pouze jednou; například aminokyselina alanin je zkrácena jako „Ala" nebo „A". Náplň peptidů v roztoku závisí na jeho kyselosti. Izoelektrický bod (pl) označuje hodnotu kyselosti roztoku, ve kterém má peptidová molekula čistý náboj rovný nule. Rozpustnost peptidu je v izoelektrickém bodě minimální. K výpočtu hodnoty pI pro aminokyselinovou sekvenci peptidu použijte dostupné webové servery.
Krok 1
Sekvenujte peptid pomocí jednopísmenného kódu. Například pokud má peptid aminokyselinovou sekvenci Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (alanin - serin - kyselina glutamová - leucin - prolin), pak jednopísmenná sekvence bude "ASELP". V případě potřeby si přečtěte převodní tabulku z jednoho písmene na tři písmena uvedenou v části Zdroje.
Krok 2
Pomocí libovolného prohlížeče, například Internet Explorer nebo Firefox, zadejte server, který vypočítává izoelektrický bod peptidu (pI); viz zdroje.
Krok 3
Zadejte jednopísmennou sekvenci peptidu - v našem příkladu „ASELP“ - do pole a klikněte na „Vypočítat“.
Krok 4
Odečtěte hodnotu izoelektrického bodu (pI) uvedenou v řádku „Teoretický pI / Mw“ (teoretický pl). V našem příkladu je pi 4,00. Všimněte si, že server také vypočítává molekulovou hmotnost (Mw) peptidu.