Protokol extrakce CTAB

Autor: Mark Sanchez
Datum Vytvoření: 6 Leden 2021
Datum Aktualizace: 29 Listopad 2024
Anonim
Protocol 1 - DNA Extraction Part 1
Video: Protocol 1 - DNA Extraction Part 1

Obsah

Chemické sloučeniny cetyltrimethylamoniumbromid, hexadecyltrimethylamoniumbromid, palmityltrimethylamoniumbromid a cetrimoniumbromid jsou také známy CTAB. Chemikálie se používá jako udržovač pH v sekvenčním genomu DNA, zejména v rostlinách.


Mletí přerušuje buněčné stěny rostlin pro extrakci DNA (Jason Reed / Ryan McVay / Digital Vision / Getty Images)

Vzorec CTAB

Množství vzorců různých CTAB chemikálií se liší v závislosti na laboratoři. Všechny složky však zahrnují 1 M Tris HC1 pH 8,0, 0,5 M EDTA, 5 M NaCl a H20 (někdy dvakrát destilované). V případě CTAB složky používají některé laboratoře cetyltrimethylamoniumbromid a další hexadecyltrimethylamoniumbromid.

Příprava rostlinných tkání

Příprava rostlinné tkáně se může lišit v závislosti na materiálu. Stěny a buněčné membrány musí být rozlomeny, aby se získal přístup k jadernému materiálu bez jakékoli degradace. Normálně při mletí umožňuje rostlinný materiál s kapalným dusíkem přístup k DNA, která udržuje škodlivé buněčné enzymy a neaktivní chemikálie.


Suspenze a odstředění

Rozdrcená tkáň se umístí na čepel CTAB a vloží do misky s tekoucí vodou. Poté se smísí s chloroformem a odstředí, aby se oddělily rozpustné proteiny a další materiály. DNA se pak vysráží z vodné fáze a opatrně se promyje, aby se odstranily kontaminující soli. Vyčištěná DNA se pak odebere a uloží na TE sklíčku nebo sterilní destilované vodě.