Obsah
Rychlost mutace je pravděpodobnost vynechání nebo změny nukleotidu v DNA způsobená buď přirozenými chybami ve zpracování DNA (spontánní mutace) nebo vnějšími činiteli (indukovaná mutace). Tuto rychlost nelze zaměňovat s frekvencí mutací, což je počet výskytů mutací v dané generaci. Míra mutace pro konkrétní druh je obvykle extrapolována z údajů a porovnává všechny sekvence DNA v průřezu druhů s těmi jejich potomky. V laboratoři se to obvykle provádí izolováním vzorku druhů a umožněním jejich množení po několik generací.
Výpočet rychlosti mutace druhů
Krok 1
Chcete-li tento proces usnadnit, získejte vzorovou skupinu druhů hermafroditů (které oplodňují vlastní vajíčka a nevyžadují partnery), které se rychle množí a pro které můžete reprodukovat životní podmínky v laboratoři. Caenorhabditis Elegans je malý druh škrkavek, který splňuje tato kritéria a byl dříve testován na rychlost mutací.
Krok 2
Sekvenujte a zaznamenávejte DNA svého druhu.
Krok 3
Izolujte co nejvíce jedinců různých druhů, abyste je mohli spravovat, udržovat a dlouhodobě pozorovat za podmínek, za kterých je známo, že tvor prospívá. Tím se minimalizuje účinek přirozeného výběru snížením vašeho genetického vzorku.
Krok 4
Pro každou generaci druhů chujte pouze jednoho potomka.
Krok 5
Nechte co nejvíce generací povstat a zemřít, všímejte si přesně toho, kolik generací pro každou linii prošlo.
Krok 6
Odeberte náhodný nebo úplný vzorek DNA z vašeho konečného potomka a porovnejte jej se sekvencí původního druhu. Spočítejte počet změn.
Krok 7
Na konci experimentu použijte následující rovnici pro výpočet rychlosti mutace pro váš druh: µ = m / (L x g x b)
kde: µ = rychlost mutace m = počet pozorovaných mutací L = počet experimentálních kmenů g = průměrný počet generací b = počet sekvenovaných párů bází